Située dans la partie du nord ouest de l’île, la Région Betsiboka est localisée entre 14° de latitude nord, 19° de latitude sud, 48° de longitude est et 46° de longitude ouest.
Cet emplacement géographique lui donne l’avantage d’avoir deux types de climat : le climat des hautes terres et le climat des côtes.
Sa superficie totale est de 33 274  km² représentant les 5.6% du territoire de Madagascar.
Elle est délimitée au nord par les régions du Boeny et du Sofia, à l’ouest par la région du Melaky, au sud par les régions du Bongolava et d’Analamanga, et à l’est par la région d’Alaotra Mangoro.